Dicen los historiadores que la fundación oficial de San Carlos y San Severino de Matanzas ocurrió en rústica capilla de madera el 12 de octubre de 1693, con presencia de Diego Avelino de Compostela, Obispo de Cuba, y Severino de Manzaneda, Capitán General de la nación, junto a unas 33 familias procedentes de Islas Canarias.
En 1695 quedó inaugurada con horconaduras y techo de guano, pero fue destruida en 1730 por un huracán, lo que motivó la construcción de un nuevo inmueble más resistente en la antigua plaza de la ciudad, hoy Parque de la Catedral.
“Los arqueólogos de la Escuela de Oficios, dirigidos por Cándido Santana Barani, hoy rescatan un promedio de 300 piezas que han armado y vueltas de nuevo a su condición original, que pertenecieron a los años de fundación de Matanzas y al desarrollo epocal de la iglesia de la ciudad, en el espacio del sitio arqueológico frente a la Catedral, en la actual calle Jovellanos entre Medio y Milanés, que se descubrieron hace cinco años.
El hallazgo de los orígenes de la iglesia y algunos elementos puntuales de fines del siglo XVII, como diversos tipos de cerámica mexicana y española, nunca antes encontradas en Matanzas, cristalería, sepulturas y restos óseos de ganado, muchas de ellas completas y en buen estado de conservación, permitirán enriquecer las certezas acerca de las cimientes históricas de la Atenas de Cuba.